近日，全球共享所有流感数据倡议（GISAID）数据库新增369条中国本土新冠病毒测序结果，上传者为上海交通大学医学院附属瑞金医院（以下简称“上海瑞金医院”）陈赛娟与上海市公共卫生临床中心（以下简称“上海公卫中心”）范小红领衔的联合科研攻关团队。
澎湃科技记者获悉，这些样本来自上海地区新冠患者，随机采集于今年11月23日至12月22日，经基因测序确认30个已知奥密克戎亚型毒株，尚未发现新的新冠病毒变异株。除了“南方株”BA.5.2和“北方株”BF.7相会于上海，在欧美广泛流行的BQ.1家族和XBB家族占比超过1/3——这些病例绝大多数为境外输入病例，处于闭环单独管理中，因此并未造成BQ.1家族和XBB家族的本土大规模传播。
未出现新的新冠病毒变异株
据上海瑞金医院官方通报，为了评估调整疫情防护措施之后奥密克戎毒株在境内的传播模式，上述研究团队分析了当前境内流行的奥密克戎亚型种类。研究论文《初步分析我国2022年秋冬新冠疫情中奥密克戎亚型多样性与流行病学特征》（Primary assessment of the diversity of Omicron sublineages and the epidemiologic features of autumn/winter 2022 COVID-19 wave in Chinese mainland）发表在《Frontiers of Medicine》上。
研究人员对2022年秋冬期间上海公卫中心收治的患者中随机抽取的378例样本进行基因组测序，获得369个高质量新冠病毒全基因组序列。分子进化树分析发现，这些病毒基因组中共包含GISAID数据库里记录的30个奥密克戎亚型毒株，其中355个（95.95%）基因组序列集中在5个奥密克戎亚系，主要毒株包括已报道在北京和广州等地流行的BF.7和BA.5.2和近期欧美地区出现的BQ.1和XBB。结合感染者的旅行史和感染接触史，证明有北京或广州疫情接触史者分别主要携带BF.7和BA.5.2亚株；从海外入境上海的感染者主要携带BQ.1和XBB；而上海本地感染者中除了BA.5.2以外，还有多个奥密克戎亚株相对占比较高。这些结果中尚未发现新的新冠病毒变异株。
BQ.1和XBB是目前欧美流行度最高的两个突变株家族。BQ.1是奥密克戎BA.5变异产生的第六代亚分支，其子系BQ.1.1已经成为全球主要流行株。而作为两个奥密克戎BA.2后代突变株的重组体的XBB，有极强的免疫逃逸能力，在出现后短短两周内就在新加坡成为主要流行株。二者在欧美广泛流行，上升趋势显著。BA.5.2和BF.7（BA.5.2.1.7的缩写）也均属于BA.5亚分支。据新加坡《联合早报》12月30日报道称，新加坡本地数据科学研究团队分析了GISAID数据库收集的中国新一波疫情期间的病毒基因组序列（来自北京、福建、广州、内蒙古和四川），并与数据库里的1440万个序列进行比较，发现它们和今年7月至12月在全球各地传播的已知毒株有着密切关系，表明中国至今并未出现新的新冠毒株。
澎湃科技记者获悉，此次上海研究团队测序的369个病例，目前无一例重症，有症状的发热病人，也未检查出任何血常规或炎症指标的异常。整体观察来看，BA.5.2和BQ.1症状相对更轻，BF.7的有症状比例略高。
12月26日，中国疾控中心病毒所所长许文波接受央视采访时称，自12月1日至26日，全国已完成1142例病例的全基因组测序，提示BA5.2和BF.7占全国流行的绝对优势，两者合计超过80%，此外还有7个奥密克戎变异株亚分支在全国流行，这些亚型没有发现有特征性的基因组突变。同时，一共发现31个奥密克戎亚分支输入国内，其中也包括正在国外加速传播的BQ.1、XBB等亚分支。
“新毒株的致病力和其他毒株没有明显区别，目前暂没有发现BQ.1和XBB在国内外引起重症和死亡增加的报道。”在12月20日的国务院联防联控机制新闻发布会上，许文波表示，近三个月以来，一共有130多个奥密克戎的亚分支输入我国，其中9个省检出BQ.1及其亚分支，3个省检出XBB亚分支。他当时指出，BQ.1和XBB在国内尚未形成优势传播，但其传播优势会逐渐增加，与目前的国内主流毒株BA.5.2和BF.7一起，加上其他50多个输入的亚分支，最终可能形成一个共循环。
XBB.1.5来势汹汹
值得关注的是，上海此次监测到的25例XBB家族中，有3例XBB.1.5，同样都是境外输入病例，未造成本土传播。研究人员表示，境外输入患者中的毒株较为复杂，多为在我国境内首次检测到。当前测序结果表明，针对境外输入新型病毒株较多，仍需要常规开展病毒株检测为后续的科学防控提供依据。
在美国，XBB.1.5已迅速成为头号流行毒株。美国疾控中心最新数据显示，近两周来，XBB.1.5在美国强势崛起，已取代BQ.1.1和BQ.1的优势地位。本周（12月25日至31日）XBB.1.5预计占美国新冠病例的40.5%，比前一周（21.7%）几乎翻一番。
最新研究显示，XBB.1.5的免疫逃逸能力与 XBB.1相当，但关键突变F486P使其具有更高的人ACE2受体结合亲和力——ACE2可以被看作是新冠病毒进入人体细胞的“大门”，这意味着XBB.1.5更容易感染人体。试验表明，在至少接种两剂mRNA疫苗的情况下，突破感染BF.7也无法诱导对XBB.1和XBB.1.5的高水平中和抗体，难以防止再感染。
国内外专家预计，XBB.1.5将会在短时间内成为全世界的主要毒株，需要密切关注。其中还有一个重要原因是，XBB.1.5 的人ACE2结合亲和力几乎与 BA.2.75 相当，可能使 XBB.1.5 未来像BA.2.75一样获得更多突变，不过XBB.1.5目前免疫压力不大，还不会很快进化。
12月24日，美国斯克里普斯研究转化研究所创始人兼所长埃里克·托波尔（Eric Topol）就在个人博客中提出“预警”：XBB.1.5“正处于井喷式增长”。他不无担忧地指出，该突变株最早在纽约州被监测到，而当地住院人数（尤其是老年人）也随之急剧上升。
“当然，其他因素也可能导致这一结果，如免疫力下降、更频繁的室内聚会、寒冷天气、缺乏缓解措施等，我们不知道XBB.1.5在多大程度上推动了这一进程，但这看起来不妙。它至少做出了贡献，看到两个数据如此惊人的共同增长也太巧合了。”托波尔写道，“未来几周，XBB占主导的相邻州的住院情况将如何发展，只有时间能告诉我们答案。”
本文作者：陈竹沁，本文来源：澎湃新闻，原文标题：《上海本轮监测到30个奥密克戎亚型毒株，尚未发现致病力增强》